VOCES ACADÉMICAS. EL MITO DE LA CAVERNA

Resumen

EN "EL MITO DE LA CAVERNA", COLABORACIÓN EN EL ESPACIO VOCES ACADÉMICAS, LOS INVESTIGADORES ALICIA GONZÁLEZ, DEL DEPARTAMENTO DE GENÉTICA MOLECULAR, DEL INSTITUTO DE FISIOLOGÍA CELULAR DE LA UNAM, Y JOSÉ MARÍA CANTÚ, DEL INSTITUTO DE GENÉTICA HUMANA, DE LA UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA, COMENTAN SOBRE LOS ESTUDIOS REALIZADOS HASTA LA FECHA SOBRE LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA HUMANO, SU IMPORTANCIA Y RETOS. SEÑALAN QUE CUANDO SE PROPUSO EL PROYECTO DE LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA HUMANO Y DE UN GRUPO DE ORGANISMOS MODELO, RESULTABA IMPOSIBLE PREVER EL AUGE QUE ELLO TENDRÍA. A LA FECHA, EL GENOMA COMPLETO DE MÁS DE 800 ORGANISMOS HA SIDO SECUENCIADO Y MÁS DE 3.5 MILLONES DE SECUENCIAS GÉNICAS HAN SIDO DEPOSITADAS EN BANCOS DE DATOS. SIN EMBARGO, SI BIEN SE CONOCEN YA CERCA DE 400 VÍAS METABÓLICAS EN EL SER HUMANO, LA FUNCIÓN BIOLÓGICA DE LA GRAN MAYORÍA DE LOS GENES AÚN ES DESCONOCIDA. INDICAN QUE EL HORIZONTE QUE SE VISLUMBRA PARA EL ESTUDIO DE LOS ORGANISMOS CUYO GENOMA SE HA SECUENCIADO -LLEGAR A CONOCER LA ACTIVIDAD BIOLÓGICA DE CADA UNO DE SUS PRODUCTOS GÉNICOS- SE HA ENSANCHADO Y EL RETO ES CADA VEZ MAYOR. "AHORA SABEMOS QUE LO VERDADERAMENTE IMPORTANTE ES UTILIZAR LA INFORMACIÓN GENERADA PARA CONOCER, NO SÓLO LA FUNCIÓN, SINO TAMBIÉN LAS INTERACCIONES DE LOS PRODUCTOS DE CADA GEN. ESTO SÍ NOS ACERCARÁ A ENTENDER LA FISIOLOGÍA CELULAR. EN POCAS PALABRAS, A ENTENDER LA VIDA". AÑADEN QUE SE REBASÓ LA ERA GENÓMICA Y LA POSGENÓMICA, Y ESTAMOS AHORA EN ERA DE LA BIOLOGÍA DE SISTEMAS, EN LA ERA DE LA INTEGRÓMICA. HABRÍA SIDO INÚTIL LA SECUENCIACIÓN SI NO FUÉRAMOS CAPACES DE INTERPRETAR LA INFORMACIÓN PARA PODER LLEGAR AL CONOCIMIENTO DE LO UNIVERSAL DE LOS GRANDES PRINCIPIOS, AFIRMAN. "LA SORPRENDENTE VELOCIDAD CON LA QUE HAN TRASCURRIDO LAS ERAS NOS IGUALAN A LOS EXTRAÑOS PRISIONEROS DE LA CAVERNA DE PLATÓN, LIBRES DE LAS CADENAS PARA SALIR A LA REALIDAD DEL EXTERIOR, PERO AÚN CONFUNDIDOS POR LA NUEVA REALIDAD DE LA QUE SÓLO CONOCÍAMOS LA SOMBRA". Y AÑADEN QUE LA VASTEDAD DE LA INFORMACIÓN DESLUMBRA COMO LA LUZ A LOS PRISIONEROS LIBERADOS. NO SE TRATA DE ESPERAR A VER QUÉ HACEN OTROS NI DE REPETIR EL TRABAJO HECHO. EL RETO AHORA, OPINAN, ES DESCIFRAR, COMPRENDER Y GENERALIZAR. ASEVERAN QUE CONOCER LA FUNCIÓN DE UN GEN IMPLICA DETERMINAR PARA QUÉ PROTEÍNA CODIFICA; CÓMO SE INTEGRA ÉSTA A LA ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE LA CÉLULA; SI ENZIMA; LA REACCIÓN QUE CATALIZA; SUS PRODUCTOS Y SUSTRATOS; SU LOCALIZACIÓN INTRACELULAR; SUS BLANCOS DE ACCIÓN; SUS INTERACCIONES CON OTROS PRODUCTOS, Y EL CIRCUITO REGULATORIO QUE DETERMINA SU EXPRESIÓN. PARA LOGRAR ESTE PROPÓSITO, DICEN LOS INVESTIGADORES, SE REQUIERE UN CONJUNTO DE ESTRATEGIAS, UNA DE ELLAS ES EL USO DE MICROARREGLOS DE ADN. Y EXPLICAN: LA PREPARACIÓN DE UN MICROARREGLO DE ADN CONLLEVA LA DISTRIBUCIÓN Y ADHESIÓN DE MUESTRAS PEQUEÑÍSIMAS DE DIFERENTES MOLÉCULAS DE ADN, CON UN ORDEN ESPECÍFICO SOBRE UNA SUPERFICIE. ESTO CONSTITUYE UNA MATRIZ SOBRE LA CUAL SE DEPOSITA UNA SOLUCIÓN CONTENIENDO ARN O ADN MARCADO CON MOLÉCULAS FLUORESCENTES. LAS MOLÉCULAS ADHERIDAS Y LAS SOLUBLES SE FUSIONARÁN SIGUIENDO LAS REGLAS DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR. A ESTE PROCESO SE LE LLAMA HIBRIDACIÓN. UNA VEZ REALIZADA ÉSTA, CON AYUDA DE LECTORES DE FLUORESCENCIA Y PROGRAMAS COMPUTACIONALES, SE DETERMINA EL NÚMERO DE MOLÉCULAS SOLUBLES MARCADAS QUE SE ADHIRIERON A CADA UNA DE LAS MUESTRAS ARREGLADAS SOBRE LA SUPERFICIE. UNA DE LAS APLICACIONES MÁS IMPORTANTES DE LOS ARREGLOS DE ADN -CONTINÚAN- HA SIDO LA EVALUACIÓN DE LA EXPRESIÓN DIFERENCIAL DE GENOMAS COMPLETOS EN CONDICIONES FISIOLÓGICAS CONTRASTANTES, LO QUE HA PERMITIDO DETERMINAR, POR EJEMPLO, LOS GENES IMPLICADOS EN LA ESPORULACIÓN O EN LA RESPUESTA A UN CHOQUE TÉRMICO DE DIFERENTES CEPAS DE LEVADURA. EN MEDICINA -SIGUEN EXPLICANDO- ESTE ENFOQUE EXPERIMENTAL HA PERMITIDO COMPARAR EL ARN EXTRAÍDO DE UN MISMO TEJIDO EN CONDICIONES NORMALES Y CANCEROSAS, Y ESTABLECER LOS PATRONES DE EXPRESIÓN ESPECÍFICOS Y PECULIARES DE CIERTOS TUMORES. EL RESULTADO ES UNA MEJOR ELECCIÓN DEL TRATAMIENTO TERAPÉUTICO Y LA PREDICCIÓN DE LA ESPERANZA DE VIDA DEL PACIENTE SEGÚN EL TIPO DE TUMOR. LA UNAM, APUNTAN, CREÓ UNA UNIDAD DE MICROARREGLOS, QUE DA SERVICIO A LA COMUNIDAD CIENTÍFICA. ESTA UNIDAD SE HA DESARROLLADO CON GRAN ÉXITO GRACIAS A LA TALENTOSA DIRECCIÓN DE JORGE RAMÍREZ, CUYO TRABAJO HA HECHO POSIBLE QUE, A UN COSTO MUCHO MENOR DEL QUE PEDIRÍAN EN EL EXTRANJERO Y CON UNA MAYOR EFICACIA, NUMEROSOS INVESTIGADORES UTILICEN ESTE RECURSO PARA ANALIZAR PROBLEMAS DE INVESTIGACIÓN BÁSICA Y APLICADA, PARTICULARMENTE EN MEDICINA. AUN CUANDO EL USO DE MICROARREGLOS HA RESULTADO DE GRAN IMPORTANCIA Y HA DADO ENORMES BENEFICIOS, SEÑALAN, HAY UNA SERIE DE PROBLEMAS A RESOLVER. UNA DE LAS LIMITANTES ES EL TRABAJO DE ANÁLISIS DE DATOS DE CADA EXPERIMENTO, QUE PERMITA DETERMINAR A FONDO EL SIGNIFICADO DE LOS RESULTADOS. ESPECIFICAN QUE ESTO QUIERE DECIR QUE EL ANÁLIS